《名侦探柯南：绀碧之棺》在浩渺的太平洋中，神海岛的宁静被柯南、小五郎及众伙伴的度假所打破。传说中，这座岛屿与沉没海底的“海底宫殿”及300年前女海盗宝藏有关。小兰和园子潜入“海底宫殿”附近，意外遭遇了寻找宝物的猎人群体。不料其中一人被鲨鱼袭击，不幸身亡。\n\n柯南和灰原在现场发现了一组神秘名词“Jolly Roger”，并开始调查此案。他坚信猎人之死与宝藏传说有关。然而，就在他试图解开谜团时，神秘猎人突然出现，并偷走了他们发现的宝藏，小兰和园子陷入危险之中。\n\n柯南面临巨大的挑战，他必须揭开隐藏在传说中的信息，解读穿越300年时光的暗号，拯救小兰和园子。海岛之谜，海底宫殿的秘密，还有那个消失的宝藏，一切都成为他迫切需要解开的问题。这场探险将是他人生中最为重要的一次挑战。^^