《机动警察剧场版1》在1999年的东京，军用机械人意外启动，天才程序员帆场瑛一自杀，两起看似无关的事件却预示着未来的恐怖。随着“Labor”大型机器人在城市中广泛出现，犯罪事件也与日俱增。为应对这一局面，警察局成立了特殊车辆二课，引入了专门机器人PatLabor处理特殊事务。随着Labor的更新换代，其电脑操作系统升级为HOS。然而，机器人失控事件频发，机动警察小队展开调查，发现是由与HOS相关的电脑病毒所致，但肇事者已销毁所有资料行踪不明。此时，巴比伦计划在东京湾建造巨型海上方舟以解决土地问题，集结了大量Labor机器人。若这些机器人失控，后果将无法想象。这部剧场版TV动画展现了东京的未来危机与英勇的机动警察们的挑战。^^