《机动警察剧场版2》在2002年冬，横浜大桥突然被声称是自卫队战机所为的爆炸摧毁，但实际并无此战机存在，这一事件令民众对自卫队产生了严重的不信任。特车二课第二小队的队长后藤（大林隆介配音）开始调查此事，发现它与99年失踪的自卫队队员柘植有关。柘植是南云（榊原良子配音）曾经的恋人，南云是特车二课第一小队的队长。随着不信任感在民众中蔓延，东京陷入戒严状态，面临大骚乱的危机。在荒川的帮助下，后藤与南云等人追查到了柘植的下落，决定重新集结特车二课的旧部，利用PATLABOR机器人进攻柘植的基地。本剧场版由导演押井守执导，续写了的传奇故事。随着情节展开，人们面临着战争爆发的阴影，故事悬念重重，紧张刺激。^^