《忍者神龟：崛起》在2044年的纽约，大反派朗格与外星恶势力勾结，开启神秘传送门，入侵地球。众多外星人摧毁了城市，忍者神龟们英勇抵抗却损失惨重。然而，他们心怀希望，决定回到过去，寻找阻止朗格的关键钥匙。李奥纳多的弟子凯西，肩负着这项重要任务，穿越时空与过去的艾普利尔·奥尼尔并肩作战。他们与忍者神龟的同伴汇合，团结一致，以“我们的未来，我们自己做主”的信念，向朗格发起终极挑战，为恢复世界和平而战。^^